松山さん、こちらこそ初めまして。
> 作品内の説明では、妖怪や魔族は霊的存在であり霊的攻撃しか効果はないようなことを言っていたと思うのですが、どう見ても物理的攻撃が効いている場面があります。
上の初めのご指摘は恐らく、例えば『父帰る!!(その３)』(第６巻)
で、忠夫が放った悪霊に果敢に反撃する大樹を見て戦慄するキヌの
「すっ…素手で悪霊を…!? (す…すごいせーしんりょくっ!!)」と
云った科白などからの類推かと思われます。
ところがざっと読み返してみた所、「全ての霊的存在に物理的攻
撃は無効」と明確に表明された科白及び描写はどうやら見当たりま
せんでした（ざっと見なので不正確かも。ツッコミ求む）。
ただ、霊的存在でも「幽霊」の場合は物理的攻撃そのものは無効
（『ただいま修業中!!』(11)参照）であるものの、逆に幽霊の方も
物理的作用を及ぼす事が（基本的には）出来ない模様です（『サウ
ンド・オブ・サイレンス!!』(９)参照）。
しかし非霊的存在も幽霊も、霊力・精神力・怨念の篭った動作な
らば、相互に影響を及ぼす事は可能の様です。まあ、結果的には物
理的効果が現れたかに見えても、その本質は飽くまで霊的な物と捉
えるべきみたいですが（『誰が為に鐘は鳴る!!(その４)』(10)の霊
刀ヒトキリマルなど）。
> テレサ登場の話でマリアが美神を襲った妖怪をロケットアームで殴ったり、香港編ではエルボーバズーカーとかクレイモアキックなどの装備でメドーサ達にダメージを与えています。
よって、この件は少なくとも３つの解釈が成り立つかと。
１、マリアは人工合成物？とは謂え霊魂を備えている為、
その攻撃は霊的な特性をも備えている
２、かの妖怪には物理的攻撃が有効である
３、１と２の両方による。
２に関しては、液体窒素で凍った雪女や（『雪の女王!!』(８)）
一介の不良にデコピンを食らう竜神族の王子（『プリンス・オブ・
ドラゴン!!』(７)）の例も在ります。メドーサも元・竜神ですし。
> さらに33巻でアシュタロスの作り出した異空間で大量の核ミサイルが爆発した時美神が「あれじゃアシュタロスもひとたまりもないわね。」と言っています。結果的にアシュタロスは生き延びていましたが、滅びた可能性を示唆しているということは一定の量があれば核兵器でもアシュタロスクラスの魔神を倒せるということではないでしょうか?
正直この意味に於いて、この令子の断定を無条件に支える根拠は
何一つ在りません（笑）。しかし『甘い生活!!(その１)』(32)以降、
２回ほど、アシュタロスに物理的攻撃が有効である旨の描写が登場
します。
その内の一つは『ジャッジメント・デイ!!(その16)』(35)。輝彦
の銃弾がアシュの額をブチ抜きますが、これは霊的性質をを伴った
攻撃だった可能性もあり、即断は出来ません。
それに引き替え、もう一つ『ジャッジ〜(13)』(34)は決定的です。」
……そう、バナナの皮と一斗缶です（笑）。従ってアシュには物理
的攻撃も部分的に効果を持つと考えられる……のかなあ？ まさか
宇宙意志が介在するとは謂え、霊力の篭った一斗缶は嫌だろうし。
> 以上のことを考えると通常兵器による物理的攻撃でも妖怪にダメージを与える、あるいは倒すことはできるのではないでしょうか?
『極楽』に於いては、霊力や精神力を伴った攻撃方法が殆ど前提
となっているので、逆にそれらを持たない存在（非霊能者）は概ね
無力なものとして描かれています（途中で霊力を数値化し出したの
がその姿勢を示す好例）。したがって、人間もしくはそれに準じた
種族以外には、単純な物理的攻撃はさほど大きな効果を与えられな
いか、殆ど意味を持たない可能性は高いでしょう。
ただ、ミサイルの件の場合、閉鎖された異空間に地球人類を滅ぼ
すだけの量の破壊兵器がブチ込まれたのですから、例え物理的に耐
性のある存在と謂えど只では済まない、と考えるのもむべなるかな、
とも想えます。